Orijinalin ilk yarısı kütle etkisi Saren'in suçlarını Konsey'e ifşa etmeye odaklandı. Turian Spectre'ın uğursuz bir şeyler çevirdiği anlaşıldığında, konsey gemiye girdi ve Komutan Shepard'ı ilk insan Spectre olarak karşıladı. İlk görevleri, onu adalete teslim etmek için Saren'i yakalamak ve yakalamaktı.
Kale'den ayrılmadan önce, Kaptan Anderson ve Büyükelçi Udina, Geth'in neden saldırdığını öğrenmek için Shepard'ı Feros'a yönlendirdi. Feros, ExoGeni Corporation'ın operasyon üssünü barındırmakla kalmadı, Geth'e uzun süre dayanamayacak olan Zhu'nun Umudu adlı küçük bir koloni de vardı. Feros'un kaderi Shepard'ın elindeydi ve Saren'in geride bıraktığı ipleri çözdüklerinde, eski Spectre'ın yozlaşması herkesin tahmin edebileceğinden çok daha derine indiği daha da aşikar hale geldi.
Görev: Feros - Kulenin Güvenliğini Sağlamak
Feros Shepard'a yanaştıktan sonra, onları Zhu's Hope'ta Fai Dan'a yönlendiren David Al Talaqani ile tanıştı. Burada Gethler, David'i sırtından vurarak ve Shepard'a ve ekibine saldırarak ilk kez ortaya çıktılar. Geth Birlikleri ile savaşın ve halledildikten sonra ilerleyin ve merdivenlerden yukarı çıkın.
Bu, yukarıdaki dar köşelere sıçrayan bir Geth Hopper'ı ortaya çıkaran kısa bir ara sahneyi tetikler. Merdivenlerden yukarı çıkın, Hopper'lara göz kulak olun ve ortaya çıktıklarında onları dışarı çıkarın. Zhu's Hope'a vardıktan sonra, kampa gidin ve Fai Dan ve Arcelia Silva ile buluşacağınız arkaya doğru ilerleyin. Bu konuşma sırasında 'Yardım etmekten mutluluk duyarım' seçeneğini seçerek +2 Paragon veya Geth'te onlar için savaşmadıklarını söylediği için +2 Dönek kazanma fırsatı vardır. Bu konuşma sırasında Gethler tekrar saldırır ve Arcelia Shepard'a kuleye gitmesini söyler.
Geth gönderildikten sonra, kulenin tepesine ulaşana kadar yol boyunca Hopper'ları alarak merdivenlerden yukarı çıkın. Panikleyen kolonist kurtarılamaz ama Shepard onları öldüren Geth'i yok edebilir. Kapıdan geçin ve kuleye ulaşmak için sola dönün. Geth Birlikleri ile savaşın ve insansız hava araçlarıyla savaşın, bir indirme gemisi uçup daha fazla birlik salarken siperde kalın. Düşmanlar, Shepard'ın seviyesine bağlı olarak Troopers, Rocket Troopers, Destroyers ve Juggernaut içerebilir. Tüm düşmanlar söndürüldükten sonra, indirme gemisinin ayrıldığını gösteren başka bir ara sahne açılır. Tıbbi seti alın ve yükseltin, ardından Fai Dan ile tekrar konuşmak için aşağı inin.
Zhu'nun Umudu etrafında yapılması gereken çeşitli görevler var, ancak bu görevin önceliği Geth'i ortadan kaldırmak ve neyin peşinde olduklarını bulmak. Merdivenlerden yukarı, asansöre açılan ve daha önce kullanılamayan bir kapı yanıyor. Asansörü geçin ve merdivenlerden aşağı inin, birkaç Hopper ve bir kolonistle karşılaşın. Geth'i çıkarın ve tünellere ulaşana kadar inmeye devam edin. Sağa dönün ve köprüyü geçin. Köprünün diğer tarafındaki kapıyı açın ve Geth keskin nişancılarını tepeden çıkarın. Tünele ilerleyin ve bir sonraki alana gitmeden önce Geth Assault Drone ve Shock Trooper'ı devre dışı bırakın.
Burada üç Krogan savaşçısı bekliyor. Onları koridora çekmek için geri çekin, sonra dışarı çıkarın. Yükseltmeyi ve işaretçinin yanındaki teknisyen kitini alın, ardından birincil görevi tamamlamak için işaretçiyi yok edin. Aktif asansöre dönün.
Misyon: ExoGeni Genel Merkezi
Hava yoluna erişmek için asansörü garaja götürün. Geth saldırısına karşı garajdaki sömürgecilere yardım edin, ardından Mako'ya girin ve gökyüzü yolunda ilerleyin. Bir sonraki istasyona giden yolda çok sayıda bariyer, Geth Birlikleri ve Armatürler var. Durup savaşmak için dışarı çıkarak ya da Mako'nun silahlarını kullanarak onları vurun. Hava yolundan düşmek herkesi öldüreceğinden ve son kaydetme noktasında yeniden başlayacağından dikkatli sürün.
ExoGeni Genel Merkezi yakınında saklanan bilim adamları var ve Shepard, içerideki insanlarla neler olduğu hakkında konuşmak için bulundukları yere yaklaşırken Mako'yu durdurabilir. Juliana'nın kayıp kızı Lizbeth'i bulmak da dahil olmak üzere burada alınabilecek birkaç yan görev var. Mako'ya geri dönün, yol boyunca Geth'e dikkat ederek ilerleyin. ExoGeni Genel Merkezi garajına vardıktan sonra dışarı çıkın ve Geth'le savaşın. Temizlendikten sonra ilerleyin ve harabelerin etrafına bakın. Arızalı bir nesneyi, bir armatürü ve bir füzyon muhafaza hücresini bulmak için kapıya yaklaşın ve içeri girmek için baypas edin. Birinin silah ateşlediği mağaraya giden açıklığa girin.
Juliana'nın kızı Lizbeth ile konuş. Geth'in Thorian adında bir yaratığı aradığını ortaya koyuyor. Kimlik kartını teslim edecek ve tam konuşma biter bitmez 10 varren saldırısı. Onlarla savaştıktan sonra tesise gidin. Merdivenlerin tepesinde, bir Krogan işbirliği yapmayan VI'ya bağırıyor. Krogan'ı çıkarın ve Shepard'ın Lizbeth olduğuna inanan AI ile konuşun, bu da ExoGeni'nin ne yaptığı hakkında söylediğinden daha fazlasını bildiğini ortaya koyuyor. Thorian'ı serbest bıraktılar ve durumu izleyip inceleyebilmeleri için sömürgecileri ele geçirmesine izin verdiler.
Zhu's Hope'dan kaçmak ve geri dönmek için karargahta savaşın. İlk alanda, ekip arkadaşları, indirme gemisini binaya tutan bacakları fark edecek. Podyumda, parlayan bir kürenin üzerinde diz çökmüş iki Geth'i gözetleyin. Onları çıkarın ve küreyi inceleyin, ardından sandığı alın. Krogan ile savaşın ve odadaki eşyaları alın, ardından bir sonraki odaya erişmek için ana alana geri dönün.
Tüm Gethler gönderildikten sonra, yalnızca 30 PSI altında kalibre edildiğinde çalışacak olan Shuttle Bay kapı kontrollerine erişin. Her düğme numaralandırılmıştır, 13, 11 ve 7 kombinasyonunu veya 17, 11 ve 5 kombinasyonunu seçmek, kapıyı kapatacak ve gemiyi binadan ayırmak için pençeyi kesecektir. Bu, Joker'in Zhu'nun Umudu'ndaki sömürgecilerin çıldırdığını duyurduğu bir ara sahneyi başlatır.
Geri dönün ve bariyerin bir zamanlar girişi engellediği alandan çıkın. Lizbeth, Mako'daki mürettebata katılır, ancak annesini iletişimden duyunca Shepard'ı durdurur. Dışarı atlayarak, onlara katılmak için aşağı koşar. ExoGeni temsilcisi, Thorian hakkında konuşma sırasında çok agresif; onunla uğraşmak, saldırgansa Renegade puanlarını veya Shepard onu sömürgecilerin kurtarılmaya değer olduğuna ikna ederse Paragon puanlarını uyandırabilir. Bilim adamları, çılgın sömürgecileri bastırmak ve onları öldürmekten kaçınmak için el bombalarıyla kullanılmak üzere Shepard'a değiştirilmiş bir sinir gazı veriyor. Skyway'e geri dönün ve ana garaja ulaşmak için Geth'ten geçin.
Görev: Thorian
Garaja vardıktan sonra, sömürgecileri nakavt etmek ve Zhu's Hope'a gitmek için Anti-Thorian gazını kuşanın. Çılgın kolonicileri hayatta tutmak için nakavt ederken Shepard azalırsa, kapının hemen içinde daha fazla el bombası olan bir sandık var. Onları canlı tutmak, daha fazla Paragon puanı verirken, tüm ağlara maksimum Renegade puanı kazandırır. Tüm koloniciler öldürüldüğünde veya öldürüldüğünde, Thorian'ın inine bir giriş yolu açmak için vinç kontrollerine erişin. Fai Dan bu noktada ortaya çıkıyor, kendisi ve Thorian'ın onun üzerindeki kontrolü ile savaşıyor. Kendini vurduktan sonra inin içine inin.
Thorian'ı inceledikten sonra, bir Asari klonu konuşmak için ortaya çıkar ve Saren'in neden geldiğini detaylandırır. Thorian'ın bundan sonra konuşmaya hiç ilgisi yok ve savaş başlıyor. Klonu çıkarın ve Thorian Sinir Düğümünü sıfırlayın, ardından pompalı tüfekle ateş edin. İninin her seviyesinde bir tane olmak üzere bunlardan toplam altı tane vardır. Her seviyede Thor sürüngenleriyle savaşırken, Asari klonu her sinir düğümü yok edildikten sonra yeniden doğar ve çıkarılması gereken toplam yedi klon üretir.
Son düğümü yok etmek Thorian'ı öldürür ve Asari, Shiala'yı serbest bırakır. Saren'in şifreyi Thorian'dan alma planları hakkında daha fazla bilgi edinmek ve şifreyi Shepard'a aktarmasına izin vermek için onunla konuşun. Shiala'nın yaşamasına izin verip vermeyeceğinize karar verin, sonra yüzeye dönün ve Normandiya'ya geri dönün. Gemiye döndüğünüzde, eğer Liara gruptaysa, fenerden gelen görüntüleri anlamanıza yardımcı olmak için tekrar Shepard'a katılmayı teklif edecek. Daha sonra herkesi görevden alın ve görevi tamamlamak için Konseyi güncelleyin.
