İkinci ve üçüncü prequel filmler arasında kalan, Yıldız Savaşları: Klon Savaşları galaksiyi temellerinden sarsacak çatışmayı detaylandırdı. Nihayetinde, hayranların çok iyi bildiği gibi, Darth Sidious'un Jedi ve Cumhuriyet'i baltalamak ve her şeyi kontrol altına almak için yaptığı plan başarılı oldu. Bununla birlikte, savaş sırasında, o sırada fark etmese de, bir kişi planlarını bozmaya herkesten daha çok yaklaştı.
Padmé Amidala hayranlarına tanıtıldı Yıldız Savaşları: Hayalet Tehdit Naboo'nun seçilmiş Kraliçesi olarak. Kraliçe olarak görevini tamamladıktan sonra, Coruscant'taki Galaktik Senato'da bir temsilci olarak gezegenine hizmet etmeye devam etti. Tahta oturduğu sırada Naboo Senatörü olan Sheev Palpatine'in yeni Şansölye olarak atanmasında önemli bir rol oynamaya devam etti. Ne yazık ki galaksi için Darth Sidious kisvesi altında çifte hayat sürdü.
Palpatine'in planlarında oynadığı rolün en iyi ihtimalle farkında olmadan olduğunu akılda tutarak, Padmé Ayrılıkçılarla savaşı sona erdirmeye çalışırken önemli bir bileşen haline geldi. Savaşın her iki taraf için de kazanılamaz bir senaryo olduğuna ve çatışmayı durdurmanın tek yolunun diplomatik yol olduğuna inanıyordu. Padmé haklıydı çünkü savaş, savaşın her iki tarafını da gizlice yöneten Palpatine tarafından yönetiliyordu.
Savaş boyunca Padmé, Senato'da savaşa karşı savaşmanın yeni yollarını bulacaktı. Çatışmanın her iki tarafındaki kötüleşen borç, kendi konumlarını büyük ölçüde zayıflattığından, Büyük Cumhuriyet Ordusuna yapılan harcamaları sınırlayacak faturalar yarattı. Padmé ayrıca Senato'nun emirlerine karşı çıktı ve Ayrılıkçılardan bir arkadaşı olan ve yine barış isteyen Mina Bonteri ile bağlantı kurdu. Eğer bu gerçekleşseydi, Palpatine'in tüm planını raydan çıkaracaktı.
Gerçek şu ki Padmé'nin çeşitli barış girişimleri neredeyse başarılı oldu. Palpatine ve yardakçıları, Kont Dooku'nun Bonteri cinayetini planlayıp infaz etmesi ve ardından barış sürecini baltalamak için Coruscant'a bir saldırı başlatması da dahil olmak üzere, operasyonlarını aksatmasını engellemek için aşırı önlemler almak zorunda kaldılar.
İronik olarak, Padmé'nin savaşı durdurmak için yaptığı her şey, Jedi'ların denediği her şeyden çok daha etkiliydi. Sözde barış güçleri, baştan kendilerine karşı düzenlenen maliyetli bir çatışmanın içine çekilmelerine izin verdiler ve tüm çabaları Sith Lordunun eline geçti. Bu, Güç aracılığıyla algılayabilmeleri gereken bir plandı ama kendi kibirleri yüzünden kör oldular.
Jedi'lar kibirlerini aşabilseydi, etraflarında hareket halindeki bir planı daha erken gerçekleştirebilirlerdi. Padmé'nin barışçıl bir çözüme olan gerçek bağlılığı, Klon Savaşları boyunca Palpatine'in tarafındaki en büyük sıkıntıydı, bu yüzden Jedi'lar onları öldürmek için tasarlanmış bir ordunun yanında savaşmak yerine onun liderliğini izleseydi, Düzen bu kadar kolay düşmezdi.
